Ses membres sont des représentants de l’État, des Régions, des organisations syndicales de salariés et d’employeurs représentatifs au niveau national et interprofessionnel, et des personnalités qualifiées. Ils sont réunis par collèges.
Le Conseil d’administration délibère sur un certain nombre de thèmes dont la liste est fixée par le décret (notamment, la fixation d’un niveau maximal de prise en charge éligible à la péréquation interbranche, le référentiel national de certification qualité, le suivi et l’évaluation de la qualité des actions de formation dispensées, la labellisation des organismes, l’émission de recommandations).
Il est tenu informé sur un certain nombre de points, également listés par le décret (notamment, travaux des commissions et des instances créées au sein de l’établissement, signalement de dysfonctionnements, consolidation de l’animation et de la publicité des travaux des observatoires prospectifs des métiers et des qualifications).